Тест проделайте:
Поставьте эту же систему на Beagleboard. Там почти такой же процессор.
Ну для начала рут файл систему записать на устройство с биглбордом и попробовать те же условия.

Это даст вам информацию, что виновато верхний уровень или кернел, бутлоадер и икхлоадер.