Это просто проценты так указывают, для наглядности. Например: вакцинировано в такой-то группе, скажем, 2 500 000. Померло за период времени, например, 50. Процент смертности по отношению к популяции - 0.002%. Чтобы не утомлять хомячков такими мелкими дробями, пишут: 2 на 100 000. Теперь понятно?