Чтобы конфа выглядела как сейчас но работала нормально в мобильных браузерах нужно отрисовать вместо фреймов два дива. В одном лесенка тредов, в другом мессаги. Подгружать треды и отрисовывать сообщения скриптом по тому же принципу что и в телефонном интерфейсе, через REST API. При этом текущий маркап и стили можно полностью сохранить. Я бы поучаствовал - отличная возможность поизучать ангуляр и всякие jQuery.