В 1987 году Ходорковский вместе с Сергеем Монаховым и Платоном Лебедевым организовал Фрунзенский районный научно-технический центр творчества молодежи города Москвы при Фрунзенском райкоме ВЛКСМ, функционировавший в системе подобных центров под эгидой Государственного комитета СССР по науке и технологиям (ГКНТ) [128], [126]. В Советском Союзе это была одна из первых легальных форм предпринимательства [202]: молодежь получила право формировать коллективы и создавать предприятия на базе райкомов для выполнения заказов советских организаций и промышленных предприятий, плативших деньги из бюджета [126]. Таким образом безналичные деньги организаций могли превращаться в наличные деньги граждан, чем пользовались некоторые сотрудники предприятий, которые сотрудничали с НТТМ и продавали свою работу дважды, получая две зарплаты - в кассе своего предприятия и в центре творчества молодежи [126], причем вторая могла быть раз в 10 больше первой [108]. Число подобных центров в Москве равнялось количеству районов, а всех директоров НТТМ назначали районные власти по рекомендации райкома комсомола [126]. Ходорковский был назначен директором Фрунзенского НТТМ [126], должность руководителя договорного отдела занял бывший программист внешнеторгового объединения "Зарубежгеология" Леонид Невзлин, а рекламный отдел возглавил Владислав Сурков [128].