Это твои или их, или они совпадают? Если ты не знаешь какие они должны быть, то надо разбираться с тем как работает их загрузка. Вообще можно посмотреть бит файл каким-нибудь хекс-редактором. Все эти опции там, если мне память не изменяет, находятся в самом конце файла, но надо разбираться, искать описание формата... Наиболее вероятные кандидаты на изменение StartUpClk и DriveDone. Последний на собственно загрузку не влияет. Еще UnusedPin:PullDown теоретически может что-то на плате куда-то не туда тянуть.