партишн в партишн копируется командой dd.

1. Начальное/текущее копирование p1 в p2 - dd;
2. на p2 - git commit - чтоб зафиксировать начальное/текущее состояние;
3. rsync p1 p2 - когда хочешь синхронизироваться;
4. когда хочешь зафиксировать состояние в которое хотел бы вернуться
- rsync p1 p2;
- на p2 - git commit
5. когда захочешь вернуться к пред.состоянию
- на p2 - git checkout <hash>
- на p2 - git commit
в этой точке у тебя на p2 будет пред.состояние
- копировать пред.состояние с p2 на p1 - dd, но загрузиться надо будет с чего-то другого, не p1, p2.